Laboratorium Proteomiki
- Ilościowa analiza różnicowa proteomu metodą otwartą (niecelowaną, tzw. shotgun proteomics), obejmująca jedoczesne porównanie ekspresji kilku tysięcy białek pomiędzy grupami eksperymentalnymi – pomiary w trybach data-dependent acquisition (DDA) lub data-independent acquisition (DIA, tzw. Next-Generation Proteomics, NGP) – Platforma Orbitrap Exploris 480 (Thermo);
- Jakościowa analiza składu białek w próbce metodą otwartą (niecelowaną – pomiary w trybie data-dependent acquisition (DDA) – Platforma Orbitrap Exploris 480 (Thermo);
- Ilościowa analiza różnicowa proteomu metodą celowaną (tzw. targeted), obejmująca jedoczesne porównanie ekspresji kilkudziesięciu/kilkuset białek pomiędzy grupami eksperymentalnymi z wysoką czułością i specyficznością – pomiary w trybach multiple reaction monitoring (MRM) z opcjonalną dodatkową fragmentacją (MRM3) – Platforma QTRAP 7500 (Sciex).
LINKEDIN