Laboratorium Obrazowania (LO-CDT-CARD) zaczyna działać! Pierwsza inwestycja infrastrukturalna w obrębie LO, realizowana w ramach programu POIR 4.2, została sfinalizowana. W listopadzie 2021 zainstalowano jeden z najnowocześniejszych na świecie odwrócony mikroskop konfokalny Leica Stellaris 8 WLL DLS. Mikroskop jest wyposażony w biały laser (oraz laser UV/405 nm), co udostępnia badaczom nieograniczone możliwości obrazowania materiału znakowanego nawet eksperymentalnymi fluorochromami, dla których nie opracowano dotąd dedykowanej wiązki lasera. Zakres spektralny mikroskopu zawiera się w przedziale od 440-790 nm z dokładnością do 1 nm. W systemie zainstalowano stolik skaningowy super galvo Z, co dodatkowo, znacząco zwiększa rozdzielczość obrazowania w osi z, pozwalając tym samym z większą precyzją „wnikać” w głąb obrazowanego preparatu. Dodatkowo w mikroskopie zastosowano technikę obrazowania digital light sheet (DLS), co czyni ten system unikatowym w skali kraju i jednym z niewielu na świecie dysponujących taką funkcją. DLS umożliwia obrazowanie preparatów o dużej objętości np. hodowli organoidowych, organotypowych, czy wręcz całych narządów poddanych odpowiedniej metodyce barwienia fluorescencyjnego.

Mikroskop konfokalny jest pierwszym dużym elementem infrastruktury LO. Docelowo, wraz z innymi urządzeniami jak np. endomikroskop konfokalny, hybrydowy rezonans magnetyczny z pozytonową tomografią emisyjną (MRI/PET) będzie stanowił swoiste kontinuum obrazowania strukturalno-funkcjonalnego obiektów biologicznych. System konfokalny, jak i cała infrastruktura LO będzie wykorzystywana przez ogół naukowców oraz podmiotów gospodarczych realizujących prace badawcze nad patogenezą oraz poszukiwaniem nowych metod terapeutycznych chorób cywilizacyjnych i związanych z wiekiem. Mikroskop został zainstalowany w specjalnie do tego przygotowanym laboratorium, w którym wydzielono pracownie obrazowania oraz pracownie analizy obrazu. Taki układ znacząco podnosi komfort pracy badawczej, ale przede wszystkim zapewnia równy, nieograniczony dostęp zainteresowanym badaczom. Ponieważ analiza złożonych obrazów wymaga potężnej mocy obliczeniowej, LO ma bezpośrednie połączenie z wysokowydajnymi serwerami, zainstalowanymi w obrębie Laboratorium Bioinformatyki i Analiz in silico (LBA-CDT-CARD), realizując tym samym założenie integralności projektu.

Zapraszamy do podjęcia współpracy z LO-CDT-CARD.

Osoba do kontaktu:

Bartek Pomierny (bartosz.pomierny@uj.edu.pl).